Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro
Заголовок | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro |
Тип публікації | Journal Article |
Year of Publication | 2016 |
Автори | Карпов, ПА, Демчук, ОМ, Брицун, ВМ, Литвин, ДІ, Пидюра, МО, Раєвський, ОВ, Самофалова, ДО, Співак, СІ, Волочнюк, ДМ, Ємець, АІ, Блюм, ЯБ |
Short Title | Nauka innov. |
DOI | 10.15407/scin12.03.044 |
Об'єм | 12 |
Проблема | 3 |
Рубрика | Наукові основи інноваційної діяльності |
Pagination | 44-59 |
Мова | Українська |
Анотація | У рамках реалізації головної мети створеної в УНГ віртуальної організації CSLabGrid було виконано пошук нових протитуберкульозних сполук. З використанням встановленої на IFBG Claster програми FlexX і моделі чотирьох перспективних сайтів зв’язування лігандів на поверхні FtsZ-білка Mycobacterium tuberculosis було виконано скринінг бази даних, що містила 2886 сполук, синтезованих в Інституті органічної хімії НАН України. На підставі показників LE і ΔG, результатів докінгу в програмі CCDC Gold і обрахунку молекулярної динаміки комплексів було відібрано групу перспективних інгібіторів FtsZ. Під час експериментальної перевірки in vitro шість речовин проявили найвищу ефективність інгібування ГТФ-азної активності FtsZ-білка. Також за результатами експериментальної оцінки in vitro було обрано три речовини, які водночас проявляють максимальне пригнічення полімеризації та ГТФ-азної активності FtsZ-білка.
|
Ключові слова | in vitro, біоінформатика, віртуальний скринінг, структурна біологія, туберкульоз |